一是适时调换种公羊。在一个羊群的种公羊连续使用两年后，与其他羊群中同一品种的公羊进行调换，以达到降低近亲交配系数的目的。

二是种公羊要单独饲养。到了配种季节，根据血缘关系远的种公羊，进行人工辅助配种或人工授精。采取这两种方法不仅可以避免近亲繁殖，而且可以控制母羊产羔时间，延长种公羊使用年限。

三是山区养羊数量大、集中的乡村，应建立羊只人工授精站，授精站应建立档案制度，包括种公、母羊繁殖登记表、羔羊登记表及后代测定记录表等。有了这些档案，血缘关系就清楚了，就可以有计划选种、选配，避免近亲繁殖。