之所以一般的消毒对发酵没有明显的影响，是因为消毒药的剂量相对于垫料数量太小，而且垫料本身具有强大的吸附作用，使得消毒药不易扩散和渗透。垫料的化学作用和发酵过程的生物化学作用对消毒剂有较快的降解效果。

　　发酵床猪舍内没有必要消毒。因为在发酵床垫料上，发酵功能菌占绝对优势，几乎没有病原微生物的生存空间。就是说，发酵床自身有消毒作用。

　　对于发酵床饲养的育肥猪，消毒的主要目的是防止猪瘟、口蹄疫、猪流感和流行性腹泻等传染性和致病性都较强的疫病传入，而对于条件性病原微生物的消杀不很必要。

　　猪场消毒的重点在与外界接触的环节上，如进出的人员、车辆以及大门口等。靠消毒药来控制病原体在一个圈舍内的传播几乎是徒劳的。

　　在周围有疫情威胁时应加强消毒，但在没有疫情威胁的绝大部分时间里没有必要频繁消毒

发酵床养殖不仅可以用到养鸭方面，还可以养猪，养鸡 ，养鹅 ，养牛，很干净的，无臭味，很新的养殖模式，很好，太方便了绿色养殖网有许多发酵床养殖的案例和一些常见问题的解决方案，你可以查看绿色养殖网
发酵床养殖成功案例

发酵床养猪技术垫料系统
绿色养猪生产的经营原则及经营形式  

一、草木灰消毒法。草木灰是农作物秸秆或杂草经过完全燃烧后的灰烬。使用浓度为3%。配制时取3千克新鲜草木灰加水10千克煮沸1小时，取上清液趁热用于圈舍和地面的消毒，此消毒法经济、安全，对病毒，细菌均有效。

二、石灰消毒法。常用10~20%的乳剂。将生石灰与水按1：7混合反应后滤除残渣后使用。此法适用于畜禽圈舍、地面、粪便和尸体消毒，对大多数病原微生物具有较强的杀灭作用。但要注意使用时应现配现用，不宜久贮。

三、漂白粉消毒法。一般配制成10~20%的混悬液使用。配制时先称好漂白粉倒入大桶中，将团块捣碎，加入少量水调成浆，再倒入其余水充分搅拌。此法可用于圈舍、食槽、车辆、排泄物的消毒。但应注意密封保存，现用现配；不能用于金属和纺织物的消毒；在饮水消毒时，一般每100千克水用漂白粉0.7克或漂白粉精2片，投入半小时后即可使用。

四、强力消毒灵消毒法。一般配制成0.05~0.1%的水溶液进行喷雾，可快速杀死金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等许多致病菌。但要注意使用时不能与还原型消毒剂合用。

五、氢氧化钠（烧碱）消毒法。此法常用于病毒性疾病消毒，如猪口蹄疫以及细菌感染时的环境和用具的消毒。一般用2%的溶液加热后喷洒。如果在其溶液中再加入少量食盐或5%的生石灰，可增强消毒力。值得注意的是：

1、消毒前应先转移畜禽，消毒5~6小时后用清水冲洗饲槽，地面，然后再进畜禽。

2、此药有较强的腐蚀性，人畜皮肤应避免药液直接接触，不能用于刀、剪、工作服、毛巾等物的消毒。

六、次氯酸钠消毒法。此法一般配制成含氯30×10-6~50×10-6的水溶液进行喷雾。此法对大肠杆菌、鸡白痢沙门氏杆菌具有强大的杀灭作用。配制时不能使用PH较高的水作稀释液，同时注意应现配现用。

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