本发明公开了一种治疗猪高热病混合感染的氟尼辛肽核酸寡聚体复合物，其结构如下。该复合物的合成方法是在环己基碳酰二亚酰胺（ＤＣＣ）和Ｎ－羟基琥珀酰亚胺（ＮＨＳ）存在下，氟尼辛与肽核酸寡聚体化合物进行固相反应，然后在氢氟酸作用下生成氟尼辛端基修饰性肽核酸寡聚体复合物：本发明的氟尼辛端基修饰性肽核酸寡聚体复合物具有治疗猪高热病混合感染所引起的疾病。