一种利用网箱养鱼的方法，先根据内河、库区水域的情况设置网箱布局的整体骨架，在骨架上设置框架；然后在框架上设置大网箱，在大网箱内养殖滤食性经济鱼类；最后在大网箱内设置精养网箱，在精养网箱内养殖投饵性鱼类。本发明提供的网箱养鱼方法，根据生态学原理，利用不同食性的鱼类进行不同水层的立体套养模式，将投饵性鱼类养殖在滤食性经济鱼类的上层，滤食性经济鱼类即可以投饵性鱼类的排泄物和残饵为食，达到了在保证现有鱼类养殖效果的情况下，减少污染物排放量，保护环境的作用。本发明还具有方法简单易学、适应性强、易于推广的优点。