牧草基因工程育种是在DNA分子水平上，按照工程设计原理那样，将分离克隆的外源目的基因，构建到特定的植物表达载体上，通过遗传转化，整合到受体牧草的DNA序列中，并经过一定的鉴定、选育之后，使目的基因所携带的性状能够定向表达，从而达到定向改良牧草性状、培育牧草新品种目的的分子育种技术。

1、牧草基因工程育种的意义

牧草基因工程育种研究的主要领域集中在：改良饲草的品质、提高牧草的抗病虫性和抗除草剂能力、增强牧草抗逆性和固氮能力、将转基因牧草作为生物反应器生产特异产物。虽然这些研究成果目前还不能大规模用于生产，但却展示出诱人的前景。

2、牧草基因工程育种的基本方法

植物基因工程育种应用了当代生物技术的最新理论成果和研究方法，主要包括目的基因的分离克隆、植物表达载体的构建、目的基因的遗传转化、转基因植株的鉴定和选育等几大步骤。

（1）目的基因的分离克隆

目的基因的分离克隆是指通过一定的技术方法，从供体生物的基因组DNA序列中，寻找和分离出调控目的性状表达的特定DNA片段（即目的基因）；并进行该片段的扩增复制的过程。分离目的基因的方法有①从基因文库分离目的基因；②从功能蛋白质组分离目的基因。

（2）目的基因的遗传转化

迄今为止，植物遗传转化成功事例报导最多的是利用根癌农杆菌Ti质粒作为转化载体。

（3）转基因植物的检测鉴定

对转基因植株可以进行外源插入片段的PCR检测、Southern杂交、Northern杂交或Western杂交等。此外，还可以对转化基因的表型性状（如抗病、抗虫、抗逆性、特异蛋白质等）及其遗传稳定性进行鉴定。通过这些检测鉴定就可以证明获得的植株是否为转基因植株。

（4）转基因植物的安全性评价

经过上述检测鉴定确定的转化植株，可以申请转基因的安全评价试验。主要就转基因植物释放对人、畜的安全性；以及对生物多样性的影响等进行安全评价，同时也对符合育种目标的植株进一步进行性状遗传稳定性等方面的鉴定筛选。一般应当经过中间试验、环境释放和生产性试验，然后才能申请领取农业转基因生物安全证书，申报新品种。