主题：关于蛆蛹的问题

在《蝇蛆立体四季高产养殖技术》中有这样一句话：2~3天后，蝇蛆全部变成红色的蛹，用一个筛子筛走麦麸，把蛹用高锰酸钾溶液进行消毒种、灭菌（10公斤干净的水、7克高锰酸钾）10分钟，捞出经过消毒、灭菌的蛹，摊开晾干，再重新放回塑料盆中，洒上少许麦麸，再盖上编织袋让蛹进行孵化。

问题：蝇蛆经过2~3天后大部分都变红色的蛹了，还有一部分未变。我是要等到塑料盆中的蝇蛆都变成蛹才去消毒？还是先把变成蛹的择出来消毒后羽化？