野生黄鳝苗种的挑选应注意以下几点：
1．定大小：自然温度下，人工饲养商品鳝时间在5—6个月，增重2-8倍，一般在3倍左右居多。而年底只有规格在100克以上的个体才有较高的价格。所以4-5月份放养的苗种尾重应在30克以上，而且随时间推迟，选养苗种也需随之增大，当年才能获取较高的养殖效益。
2．知来源：黄鳝苗种有人工繁育和自然捕获二种来源。人工繁育苗质量稳定，但目前极少，难以满足人工养殖的需要；自然水域捕获野生黄鳝方法主要有笼捕、电捕、针钓、药捕、针*和徒手捕捉等。其中只有笼捕苗种成活率高，而另外几种方法所获苗种成活率低。因此，挑选时应先掌握苗种来源途径。
3．看体色：常见的黄鳝品种有：深黄大斑鳝，该种鳝个体肥壮，体色深黄，背部和两侧分布不规则褐黑色大斑，大斑从体前端至后端在背部和两侧联接成数条斑线；土红大斑鳝，其体色土红，尤以两侧较明显，其它特征与深黄大斑鳝相似；浅黄细斑鳝，体色浅黄，斑点细密，不明显，几乎无斑线；青灰细斑鳝，体色青灰，身体上有点状褐黑色斑点，但不形成斑线，人称花鳝。实践证明，前二种鳝生长速度最快，是人工养殖的最优良品种。
4．查疾病：挑选鳝苗时常见有四种疾病：鳝体表有明显红色带血块状腐烂病灶，为腐烂病；尾部发白，粘液脱落，为水霉病；头大体细，甚至呈僵硬状卷曲、颤抖，为体内寄生虫病；肛门红肿发炎突出，为肠炎病。凡带有该类疾病的鳝，选用时均应剔除。
5．探外伤：以口带血有针眼，头部及皮肤擦伤，腹部皮肤磨伤，身体有*眼等常见。腹部磨伤，如果腹部不朝上较难发现，应注意检查。如将黄鳝倒入3％—5％的食盐水中，受伤个体会立即窜跳起来，这类鳝也在淘汰之列(但也有部分特别敏感的健康鳝会窜跳，应检查外表，仔细辨别)。
6．试力量：健康鳝，手抓时感觉鳝体硬朗并有较大的挣逃力量；手抓即着，柔软无力，两端下垂者为不健康鳝。
7．摸粘液：病伤和中毒黄鳝，全身或局部粘液脱落或减少，手抓无光滑感或光滑感不强，或粘液明显脱落。黄鳝一旦失去屏障作用的粘液就不能存活。
8．观敏感：将黄鳝倒入浅水的盆中，游姿正常，稍遇声响或干扰，整盆黄鳝会因忽然受惊抖动而出水响声，说明黄鳝敏感健康。那些“浮头”，肚皮朝上的属不健康个体，应剔除。