一、育苗池消毒
河蟹育苗池经过冬季清淤曝晒后，在育苗开始前通常以生石灰进行池底消毒。而以漂白粉进行池壁消毒不，即先用生石灰每亩200千克进行带水(20厘米左右)消毒，然后将漂白粉以50：1的比例制成液体，依次泼洒到土池的四壁。要求均匀、到位，以毂到杀菌及驱赶敌害的作用。
二、孵幼水体消毒
在土池消毒工作结束，孵幼开始前5~7 入池(池水必须经120目以上筛绢过滤，以下均同)随即放入漂白粉，使整池水达到40~60克/立方米。这样，等I期蚤状幼体出膜后立即可获得一个洁净的、充满活饵的生水体。
三、蓄水池消毒
为保持育苗池水体质量，防止有害菌及敌害生物进入育苗池，通常可采取二级过滤方法，对蓄水池用漂白粉杀菌后的水体一必须经过48小时后方可注入育苗池。
四、丰年虫孵化消毒
每次丰年虫孵化前，都必须对孵化是行冲洗、消毒。即先以过泚、滤水冲洗整个池子，然后依次对水泥四壁及池底用200毫克/升的漂白粉过滤进行泼洒，或用水勺从孵化池顶端沿四壁慢慢倾倒。这样可有效防止丰年虫卵的结块现象，提高丰年虫卵的孵化率及膜后的成活率。
五、必须先消毒、后孵化，即将要孵化的丰年虫卵装袋用过滤水漂洗，然后放入浓度为500毫克/升的漂白粉溶液中浸泡5~6小时，这样既可以杀死依附在丰年虫卵开裂，加速丰年虫出膜，缩短孵化时间，增加饵料供给。
此外，在丰年虫卵孵化水体中可适量施放漂白粉，防止丰年虫卵出现结块现象，提高孵化率、成活率。