在鱼苗培育过程中，由于鱼苗个体较小，活动能力差以及饲养管理条件和环境因素的作用，常受到一些病害与敌害的危害，直接影响鱼苗的成活率，现介绍几种对鱼苗鱼种危害较大的常见病害和敌害的防治方法。
小瓜虫 在病鱼的鳃部及体表形成“小白点”，虫体多时易致鱼死亡。此病可用辣素疗法，即用1.5ppm干辣椒粉和1ppm的生姜合剂加水煮沸30分钟兑水全池泼洒，每日一次，连续2次~3次，疗效好又经济。切勿用硫酸铜来治疗，否则，不但不能治好，而且会加重鱼的病情。
车轮虫 该虫体寄生于鱼体表与鳃部，刺激鱼体产生大量黏液，出现“红头白嘴”现象，对夏花鱼种危害较大。可用0.7ppm硫酸铜和硫酸亚铁合剂（5：2）全池泼洒来防治，也可用苦楝树枝叶，按每亩池塘每米水深用60斤煮汁全池泼洒来治疗。