二氧化碳辅助活鱼运输是一项使活鱼长时间处于睡眠状态以减少运输费用的新技术。用二氧化碳辅助运输鲤成鱼时，须分别用含有高分压（27－33KPa）和低分压（13－17KPa）的二氧化碳气体交替灌流鲤成鱼，经15-30分钟后鱼即进入休眠状态，运输时间可维持10小时左右，死亡率很低。用二氧化碳和氧气（50：50）的混合气体也可辅助运输活鱼。这时可直接往装有鲫鱼和鲤鱼的水体中注气，使鱼在水中的行为逐渐迟钝。约25分钟后，鱼便沉到水底“睡眠”。此时可将鱼从水中捞出装入塑料袋或箱、盒中进行运输，持续时间可超过30小时。当鱼运到目的地后，再将它们放入水中并吹入氧气，5分钟后即可苏醒。
碳酸用于活鱼运输时，不是直接采用碳酸，而是用由碳酸氢钠和硫酸发生化学反应所产生的碳酸。使用前要预先分别配制浓度为6.75％（G／V）的碳酸氢钠溶液（简称A液）和浓度为 3.95％（G／V）的硫酸溶液（简称B液）备用。使用时将等量的A液和B液的用量按下式计算：
A液或B液的用量（毫升）＝ 药品浓度 水的总体积升数／50
例如：若配制1200ppm的运鱼药水0.5升，则有： A液或B液的用量（毫升）＝12００ O.5／50＝12（毫升） 即分别取A液12毫升，B液12毫升加到476毫升清水中即可。
经碳酸处理后的鱼，一般反应表现为：鱼体失去平衡，侧卧或仰卧，呼吸频率减慢，行动迟缓，代谢活动显着降低。该药品运鱼时的适宜剂量为150－600ppm，最佳剂量为500ppm。水温22摄氏度时，鱼类存活时间为6－13小时。用于鲤鱼鱼种运输时，存活时间可达25小时。用于淡水白鲳鱼苗运输时，存活时间可达201小时（10％的死亡率）。
碳酸氢钠和硫酸购买方便，价格便宜，配制和使用容易，是一种较好的活鱼运输辅助剂。