据秦爱建教授介绍，奶牛在患上结核病后，会将体内的结核菌素分泌到奶汁内，挤出来的奶就会携带结核菌素。而这样的奶和健康牛产出的奶相比，味道、颜色均没有明显差别。人在喝了这样的牛奶后，就会把结核菌素带入体内，增加患结核病的风险。在欧美等发达国家，通行的做法是，使用牛干扰素测试结核菌素，但在国内牛干扰素测试技术还处于空白阶段。为了攻克这一难题，秦爱建的团队潜心研究国外的资料，他们逐步开发出了可以测试结合菌素的牛干扰素，并掌握了使用干扰素测试结核菌素的方法，填补了国内这一方面的空白。秦爱建介绍，虽然这项课题目前还没有结题，但已经获得省科技厅的立项支持。课题结题后，将向奶牛场推广这项技术。
另外，秦爱建教授针对眼下愈演愈烈的新西兰奶粉“肉毒杆菌”事件也表达了自己的看法，“奶牛是否患病，饲料是否安全，这些都会影响奶品的质量。等牛奶制成奶粉，再去追查是否遭到污染，为时已晚。”他认为乳制品的安全不能只从乳制品企业抓，乳源地的安全才是关键。