为了推动奶牛业的规模化、标准化、规范化生产，应坚持“预防为主”的方针，控制和减少奶牛疫病的发生，保证奶牛业的健康发展。
1.免疫接种
1.1 口蹄疫免疫程序
犊牛：出生后4-5个月首免，肌注牛羊“O型”口蹄疫灭活疫苗（单价苗）2ml/头或牛羊O、A型口蹄疫双价灭活苗（多价苗）2ml/头；首免后6个月二免（方法、剂量同首免），以后间隔6个月接种一次，肌注单价苗3ml/头或双价苗4ml/头。
生产母牛：分娩前3个月肌注单价苗3ml/头，或双价苗4ml/头。
种公牛、后备牛：每年接种疫苗2次，每间隔6个月免疫一次，单价苗肌注3ml/头，双价苗肌注4ml/头。
1.2 炭疽免疫程序
每年10月份进行炭疽芽孢苗免疫注射，免疫对象为出生1周以上的牛，次年的3-4月份为补注期。炭疽疫苗有3种，使用时任选一种。
无毒炭疽芽孢苗：一岁以上的牛皮下注射1ml。一岁以下的牛皮下注射0.5ml。
Ⅱ号炭疽芽孢苗：大小牛一律皮下注射1ml。
炭疽芽孢氢氧化铝佐剂苗或浓缩芽孢苗：为上两种芽孢苗的10倍浓缩制品，使用时以1份浓缩苗加9份20%氢氧化铝胶稀释后，按无毒炭疽芽胞苗或Ⅱ号炭疽芽胞苗的用法、用量使用。以上各苗均在接种后14天产生免疫力，免疫期为1年。
1.3 猝死症免疫程序
使用疫苗为牛羊厌氧氢氧化铝菌苗。
奶牛：皮下或肌肉注射，每头5ml。
1.4 泰勒焦虫的免役程序
使用牛环形泰勒焦虫疫苗，在每年的1-3月份对出生后12月龄以上的奶牛，进行一次免疫，每头肌肉注射1ml，免疫期为一年。
2 卫生消毒
2.1 环境消毒
牛舍周围环境及运动场每周用2%氢氧化钠或撒生石灰消毒一次；场周围、场内污水池、下水道等每月用漂白粉消毒一次。
在大门口和牛舍入口设消毒池，使用2%氢氧化钠溶液消毒，原则上每天更换一次。
2.2 人员消毒
在紧急防疫期间，应禁止外来人员进入生产区参观，其他时间须进入生产区时必须经过严格消毒，并严格遵守牛场卫生防疫制度。饲养人员应定期体检，如患人畜共患病时，不得进入生产区，应及时在场外就医治疗。喷雾消毒和洗手用0.2%-0.3%过氧乙酸药液或其他有效药药液，每天更换一次。
2.3 用具消毒
定期对饲喂用具、料槽、饲料床等进行消毒，可用0.1%新洁尔灭或0.2%-0.5%过氧乙酸，日常用具，如兽医用具、助产用具、配种用具、挤奶设备和奶罐等在使用前后均应进行彻底清洗和消毒。
2.4 带牛环境消毒
定期用0.1%新洁尔灭、0.3%过氧乙酸、0.1%次氯酸钠等进行带牛环境消毒。消毒时应避免消毒剂污染到牛奶。
2.5 牛体消毒
挤奶、助产、配种、注射及其他任何对奶牛接触操作前，应先将有关部位进行消毒。
2.6 生产区设施清洁与消毒
每年春秋两季用0.1%-0.3%过氧乙酸或1.5%-2%烧碱对牛舍、牛圈进行一次全面大消毒，牛床和采食槽每月消毒1-2次。
2.7 牛粪便处理
牛粪采取堆积发酵处理，牛粪便堆积处，每周用2%-4%烧碱消毒一次。