曲霉菌病对雏鹅致死率高，切不可漫不经心，要采用以防为主的综合性防治办法。
平常特殊是霉菌病好发季节，要留意对垫草和室内环境进行按期消毒以杀灭霉菌及其孢子。垫草消毒可用2％甲酚皂、1：2000硫酸铜溶液或1：1600的百毒杀等喷雾散，维持3小时之后晒干备用。其中，以1：2000硫酸铜溶液为好，高效低毒。室内环境按期消毒可用1：2000硫酸铜溶液，或用1：1600的百毒杀喷雾，或用福尔马林熏蒸。维持鹅舍的清洁卫生，通风干燥。垫料要常常翻晒，发现发霉时，育雏室应彻底清扫、消毒，然后再换上清洁的垫草。
霉敌（有效成分为硫化苯唑）具备清除曲霉菌属霉菌污染的作用，可显然降落孵化器及种蛋上霉菌污染的水平。霉敌为烟熏片剂，每片60克，含硫化苯11。7％。在种蛋孵至第17天时（即转蛋前1天），将片剂放入孵化器内烟熏。如饲养场污染严峻，雏鹅中常发生本病时，需在种蛋放入孵化的当天加熏2次。用量为每100立方米空间用药4—8片。烟熏时人、畜不得进入孵化室，以防中毒。
本病无特效医治药物，制霉菌素有一定疗效，用量为每100只雏禽用50万单位（1片），混饲内服，连用3天，停药2天，连续2—3个疗程，同时，以1：3000的硫酸铜溶液饮水，连用3—5天。据报道，两性霉素B或克霉唑（抗真菌1号）医治也有一定效果。也可内服灰黄霉素。
也可使用碘制剂，用量为每升水中加入碘化钾5—10克，给雏饮用；成鹅可用碘1克、碘化钾1。5克加蒸馏水1500毫升，溶解后采用气管内或咽喉内注射，每只4—5毫升，当日配制，当日使用，用时加热至25℃，一次注射即可。