实施疫病监测与净化，从源头上控制疫病的传播与流行是最有效的措施。
1.合理使用兽药 要努力提高喂养管理水平，增强鸭的抵抗力，尽可能使鸭少生病，以减少用药。通过正规渠道购买正规厂家生产的合格兽药，并严格按规定使用。尽量使用无公害、无残留的抗生素替代药，如中草药制剂、防御素、卵黄抗体等。严格执行休药期（休药期是指从停止给药到允许动物或其产品上市的间隔时间）。注意拟定科学的给药方案。要严格按疗程给药，正确用药，防止药物配伍禁忌，建立药物使用档案。
2.慎用消毒剂 根据消毒目的选择消毒剂，应选择高效、低廉、使用方便、对人与家禽安全、无残留毒性，并且在禽体内不产生有害物质的消毒剂。反复消毒时最好选用两种以上化学性质不同的消毒剂。
3.环境卫生要求鸭场内要保持环境清洁卫生，垃圾、粪便、病死鸭要及时清运出场或做无害化处理。随时清扫鸭舍，保证光照充足、空气清新、温度适宜。做好灭鼠工作，场内不得喂养其他家禽、家畜。鸭场应设有病害禽尸无害化处理设施，以及粪便、污物发酵池等，这些设施应建造在种鸭场下风向处。
4.以防为主，防重于治 无论是在鸭场设计建造、鸭苗引入，还是在喂养管理的整个过程中，都必须从消灭传染源、切断传播途径、增强鸭的抵抗力3个环节着手，严防传染病的发生。如不从疫区引种，采用全进全出制喂养工艺；对进出场区人员、车辆进行防疫消毒，建立种蛋、雏鸭消毒程序与饮水及饲料消毒程序等。
5.鸭群免疫 种鸭喂养周期较长，对种蛋孵化与雏鸭成活影响大，应随时监测鸭群抗体水平，根据监测结果及鸭群状态确定是否进行免疫注射。对于非种鸭的防疫可按兽医防疫部门推荐的防疫程序进行。