为了彻底解决药物防治所带来的日益严重的耐药性及药物残留问题，人们逐渐找到了用疫苗预防鸡球虫病的办法。
目前，用于鸡场计划免疫的球虫活苗有早熟、中熟、晚熟及早、中、晚熟系联合球虫苗四类。由中国农业大学推出的Einerivac球虫苗，系早、中、晚熟系联合球虫苗，安全、高效、价廉。
球虫活苗的免疫方法目前有滴口法、喷料法、饮水法及喷雾法等，以滴口法为最佳，可确保100%免疫，但对于大鸡场则有些不便且应激大;喷雾法较适用于设备先进的孵化室，饮水法和喷料法是大鸡场较为适用的免疫方法。实践证明，采用球虫疫苗对鸡进行预防免疫将是非常有前景的一种方法，将为养鸡业的发展带来显著的经济效益和生态效益。