鸡异刺线虫在盲肠寄生时，能损伤盲肠黏膜，引起出血；其代谢产物可使机体中毒。幼虫寄生于盲肠黏膜时，可引起盲肠肿大，盲肠壁上形成结节，有时发生溃疡。病鸡主要表现食欲不振或废绝，贫血，下痢和消瘦。成年母鸡产蛋量下降，甚至停止产蛋，幼鸡生长发育不良，逐渐衰弱引起死亡。此外，鸡异刺线虫还是鸡黑头病的病原体、火鸡组织滴虫的传播者。
当同一只鸡体内同时有异刺线虫和组织滴虫寄生时，组织滴虫可侵入异刺线虫的卵内，并随之排出体外。组织滴虫得到异刺线虫卵壳的保护，不致受外界环境因素的损害。当鸡食入这种虫卵时，同时感染异刺线虫和火鸡组织滴虫，导致鸡发生黑头病，即盲肠肝炎，极易死亡。