全进全出的最终目的：一是把日龄和体况相近的猪集中饲养，便于环境控制和疾病防治，二是可以出栏后便于彻底消毒，有一定的空栏期。不能正确理解这两个目的，全进全出就达不到应有的效果。一股脑把一群猪赶到一起饲养，不是真正意义上的全进全出。
在疾病肆虐的今天养猪，我们更应该充分认识全进全出的重要意义。
1、全进全出是有效预防疾病的根本。每个猪群自身都带有不同的微生物，各种因素经常导致猪群免疫力低，疫苗接种后抗体滴度低等。只有坚定不移的执行全进全出，才能有效防止新的病原体感染猪群。
2、全进全出才能真正做到彻底消毒。不少人觉得消毒不解决多少问题，原因在于消毒是否彻底。一般消毒方式，很难杀灭粪便等有机质中的病原微生物。彻底消毒的方法在养猪必赚宝典之疾病控制中有论述。
3、全进全出可以最大限度减少应激，把日龄、体况相近的猪集中到一起饲养，便于环境控制更适合每头猪。
4、全进全出可以显著提高猪的抗病力。在新的洁净的环境下，猪群逐步接触环境中的微生物，可以逐步产生免疫力。
有人做过实验，连续进出和全进全出相比，0—35日龄猪的日增重和采食量如下：连续进出平均日增重和日采食量分别为322克和631克；全进全出平均日增重和日采食量分别为372克和681克。