与常规养猪日常管理基本相同，但也有其特殊之处：
.①猪的饲养密度.单位面积饲养猪的头数过多床的发酵效果就会降低，一般以每头猪占1.2～1.5米为宜，小猪可适当增加密度。
②发酵床的床面.不能过于干燥,具备一定的适度有利于微生物的繁殖，若过于干燥,还有可能引起猪的呼吸系统疾病,可定期向发酵床喷洒活性剂溶液。
③驱虫.入圈生猪应提前彻底清除体内寄生虫,避免将其带入发酵床，使猪在啃食菌丝时将虫卵吞入肚内感染。
④微生物菌群的活性.要密切注意土壤中微生物菌群的活性，必要时要加入活性剂进行调节,以保证发酵的正常进行.若猪舍中木屑变少，应适当补充微生物原种和活性剂溶液。
⑤饲喂量.为使猪方便拱翻地面,饲料喂量应控制在正常量的80%。生猪一般在固定地点排粪、撒尿,待粪便成堆时挖坑填埋即可。
⑥地面适度.经常检查猪舍地面湿度,将其控制在60%左右，水分过多时可打开通风口,利用空气流动调节湿度。
⑦用药注意.猪舍内不得使用化学药品和抗生素类药物，因其对土壤微生物具有杀害作用,会使微生物活性降低。