由于牧草生长特性复杂，花序形态各异，许多牧草结实种子排列不成穗状，在植株上的位置很分散，而且同一植株上种子成熟期又不同，这样就必须采用特殊的收获方法。
1.直接收获法
在牧草种子成熟后直接用联合收割机收获种子，适应于种子较大、或生殖枝高而整齐的禾本科牧草，如燕麦、新麦草等。在豆科牧草中，适用于株型直立并且经干燥剂处理的种类，如红三叶、紫花苜蓿等牧草。豆科牧草种子成熟时，植株还未停止生长，茎叶处于青绿状态，给种子收获带来很大困难。因此，在种子收获之前要进行干燥处理，常用飞机或地面喷雾器对田间生长的植株施化学干燥剂，在喷后 3～5天，直接用联合收割机进行收割。干燥剂为一些接触性除莠剂，如敌草快，用量为1～2kg/hm2，敌草隆用量为3～4L/hm2，利谷隆用量为 3.2kg/hm2。对于收获季节多雨地区采用联合收割机直接收获将是最佳选择。
2.采集收获法
针对禾本科牧草，通过专用的牧草种子采集收获机，无需刈割牧草而直接收获种子。在不切割牧草的情况下，用采集器将种子从穗上直接脱粒，以风或输送带等形式将种子集中在特定的容器内。主要适合穗头高低整齐、种子主要生长在植株顶部、种子成熟期不一致而且落粒性强的禾本科牧草。