而生猪养殖污染主要分为两类：一是死猪无害化处理并不彻底，随意抛弃造成水源、土壤污染，严重的甚至可能滋生疫病；二是养殖业的排泄物污染严重，且收集和处理十分困难。
可以说，此次上海黄浦江死猪漂浮事件让一度被忽视的中国养殖业污染问题正式浮出水面。这一事件表明，继水污染、大气污染、固废污染之后，大量的养殖业污染正成为中国环保新挑战，且养殖污染也仅仅只是农业污染的一小部分。
与工业污染不同，养殖业污染散布在农村各地，被称为面源污染。过去几年，中国各地对工业污染高度重视并采取了多种措施，但养猪这样的传统农业面源污染却没有引起足够重视。而事实上，畜牧业的污染危害并不比工业污染低。
环保部和农业部公布的数据显示，2010年中国畜禽养殖业的化学需氧量和氨氮排放量分别达到1184万吨和65万吨，占全国排放总量的比例分别为45%、25%，占农业源的95%、79%。养殖业污染已成为部分水体水质恶化的重要污染源。
以养猪业为例，中国目前的养猪量占全球总量的一半，每年产生粪便6亿多吨。更为关键的是，这些污染散布在全国的千万个农村，收集和处理几无可能。同时，随着肉禽在日常消费中的占比提高，养殖业的规模不断增大，污染呈上升态势。
面对这种情况，国务院去年7月份出台了《畜禽养殖污染防治条例(征求意见稿)》，明确提出了畜禽养殖污染防治办法及具体措施。但就农村的实际情况看，养殖业污染问题未得到有效遏制。
畜牧方面的专家指出，这一事件表明，养殖业造成区域性水质、环境污染的风险在加大，养殖业污染很可能成为下一轮环保问题的“引爆点”，中国亟需采取措施应对这一新挑战。