近代营养分析证明，蝇蛆是优质的食品蛋白资源，不仅蛋白含量高，氨基酸组成合理，蛋白纤维少，易于消化吸收，而且所含的脂肪与鱼油中的脂肪类似，还含有足够数量人类食物中所必需的其他营养成分，各项营养指标均大于鸡肉、猪肉、牛肉、甲鱼等蛋白类营养物质。虽然让人们直接取食蝇蛆原形食品还存在诸多感官和心理障碍，但利用蝇蛆蛋白作为添加剂生产各类变形食品和保健品的技术已经比较成熟。
蝇蛆具有广阔的深加工利用前景。研究表明，蝇蛆具有较强的清腐抗菌作用和较高的药用价值，可开发成具有较高附加值的氨基酸类和中药类饲料添加剂。家蝇体内含有多种生物活性成分，可以开发出新型医药，如具有强烈杀菌作用的“抗菌活性蛋白”，具有抗癌作用的“凝集素”，具有保护细胞膜、降血脂、防心血管疾病等作用的磷脂等。几丁质可广泛应用于工业、医药、食品、日用化工、国防、环保、农业等诸多高新技术领域，而蝇蛆壳皮和蛹壳中含有丰富的几丁质，可通过生物化学的方法直接提取。当然，蝇蛆的深加工目前多停留在实验室研究开发阶段，大规模加工利用的技术含量较高，需要现代高新技术设备支持和大量的经费投入，家庭式小规模生产的产品很难达到产品质量的要求。
蝇蛆是处理农业废弃物的能手。不仅可以用麦麸、米糠、酒糟、豆渣等农副产品下脚料养蝇蛆，生产优质蛋白，而且可以用人和畜禽粪便饲养蝇蛆，变害为利，化废为宝，能有效解决困扰畜禽生产的粪便污染和蛋白饲料紧缺这两大难题，经蝇蛆处理后的畜禽粪便既无臭味，又肥沃疏松，是农作物的优质有机肥。分析结果表明，蛆粪中有机质占19．8％、全氮占2．3％、全磷占2．65％、全钾占1．83％。据俄罗斯试验证明，按20吨／公顷的施肥量施用蛆粪，与施用全价化肥相比，可使燕麦增产20％，燕麦和豆类套种增产18％；与单施磷钾化肥相比，燕麦增产57％，燕麦和豆类套种增产38％；同时施蛆粪和磷钾化肥对燕麦和豆类套种增产作用更大，比施全价化肥增产68％，比单施磷钾肥增产96％。 | 
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