工业微生物菌种主要是处理工业有机固体废弃物的微生物菌种，生物处理工业有机固体废弃物，利用工业微生物菌种处理工业有机固体废弃物可以变废为宝。经过工业微生物菌种处理的有机固体废弃物，可以发酵制造成生物有机肥种植农作物种植果蔬；经过工业微生物菌种处理的有机固体废弃物，减少对环境的污染，净化生态环境。
    工业有机固体废弃物是指人类在生产、消费、生活和其他活动中产生的固态、半固态废弃物质通俗地说，就是“垃圾”。如：发酵后的酒糟、垃圾、炉渣、污泥、有机能源、废弃食品、废渣等。
    生物处理技术是利用工业微生物菌种对有机固体废物的分解作用使其无害化可以使有机固体废物转化为能源、食品、饲料和肥料，还可以用来从废品和废渣中提取金属，是固化废物资源化的有效的技术方法，目前应用比较广泛的有：堆肥化、沼气化、废纤维素糖化、废纤维饲料化、生物浸出等。
    焚烧、填埋等常规处理方式不能从根本上解决污染问题，污泥直接焚烧的热值过低，还要治理有害气体、粉尘污染，污泥焚烧的一次性投资和运行成本过高，需要国家提供大量的补贴和各项优惠政策才能够运行。城市垃圾卫生填埋工艺中最难处理的温室气体排放问题、恶臭问题、渗滤液问题都是由垃圾中的有机物引起的，污泥进入垃圾填埋场还存在难于压实，难于自然发酵的问题，直接影响垃圾填埋的土地再利用，被埋入地下的污泥也是对环境的一个潜在的威胁。更重要的是因为有机废弃物的处理方式和农民用肥习惯的改变，大部分有机物无法返回土壤中，破坏了土地的自然循环。
    随着我国经济的持续快速发展,包括城市污水污泥、城市生活垃圾、工业废弃物等在内的有机固体废弃物的产生量也日益剧增。工业微生物菌种有机废物的好氧堆肥法处理速度快、无害化程度高、最终产物可作为有机肥料而受到各国的普遍欢迎。有机固体废弃物的堆肥化处理是利用有机废物中大量存在的微生物在人工创造的较适环境条件下对有机废物进行生物降解的既安全又有效的处理方式,其产品可以作为土壤调理剂或有机肥料。
    工业有机固体废弃物堆肥的腐熟度是评价堆肥稳定性及安全性的重要指标。如果堆肥没有腐熟就施入土壤,会造成土壤速效养分缺乏,导致作物生长不良。工业微生物菌种因此,构建快速、准确和适应较强的评价有机固体废物堆肥腐熟度的方法既是堆肥厂工艺改进、产品市场化的客观要求,也是提高产品质量,促进生态良性循环,增加农作物产量和增加农民收入必然要求。
    工业有机固体废弃物对大气、水体、土壤、生物均造成严重污染,但是,工业固体有机废弃物又是可利用的生物质资源,蚯蚓堆制处理是工业固体有机废弃物处理和资源化利用的重要途径之一,蚯蚓堆制产物即蚓粪是一种具有极高应用价值的腐殖质类复合物。综述了农业固体有机废弃物蚯蚓堆制处理的影响因素如蚯蚓品种、温度、湿度、接种密度、pH值、C/N以及蚓粪的理化、生物学性质及蚓粪应用的研究现状,指出对工业固体有机废弃物进行有效蚯蚓堆制处理及提高蚓粪利用范围和效果等问题值得深入研究。