北京协和医院和华大基因等机构的研究人员近日合作完成了类风湿关节炎（ra）口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示了口腔和肠道微生物菌群异常是ra病理生理和疾控的重要环节，并且为元基因组学辅助的ra个性化诊疗方案提供基础。研究成果发表在《自然·医学》杂志。

本研究中，北京协和医院和华大基因的团队合作，收集了未经dmards（抗风湿药）治疗ra患者的牙菌斑、唾液和粪便样本，以健康人群（包括直系亲属和共同生活无血缘关系亲属）作为对照，采用元基因组鸟枪法测序技术检测微生物组dna，并对dmards治疗前后ra患者的口腔和肠道微生物菌群的变化进行了对比研究。

项目的主要完成人之一、华大基因研究员介绍，某种嗜血杆菌（haemophilussp）（治病菌）在ra患者中呈现相对缺失的状态，并且其丰度与ra自身免疫抗体的滴度成反比。而唾液乳杆菌（lactobacillussalivarius）（益生菌）在ra患者的牙菌斑、唾液和粪便中均显著富集，尤其是在病情高度活动患者中表现得尤为明显。

研究人员还发现，ra患者的口腔与肠道菌群，在氧化还原条件，铁、硫、锌和精氨酸的转运和代谢，以及ra相关抗原如瓜氨酸环化的分子拟态等方面均表现出明显异常，提示这种菌群异常在ra的病理生理机制中具有重要的作用，可能直接参与疾病发生。