1.1 家禽肠道微生物的概念

    家禽肠道微生物是指寄居在家禽消化道内微小生物的统称，主要包括细菌、古菌、真菌、病毒等。其中一部分为长期寄居的微生物,在机体防御机能正常时是无害的,称为正常菌群或正常微生物群,而另一类则是致病菌或者条件致病菌，当机体防御功能异常时，会诱发家禽的疾病，如：大肠杆菌、沙门菌、弯曲杆菌等。

1.2 家禽肠道菌群的优势菌群

    研究表明，微生物存在于家禽的整个消化道中，且不同物种、不同日龄、不同肠段中的微生物组成存在着较大的差异。最新研究表明，厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门在几乎所有的禽类中都是优势菌，例如：丹顶鹤 、中国本地鹅 、肉鸡 、北京鸭 。但它们在家禽消化道内定植的时间有差异，研究发现，出生前3 d的北京鸭肠道中变形菌门占主导地位，从第4天开始出现厚壁菌门，直到第8天厚壁菌门开始成为优势菌。而在肉鸡的生长过程中，厚壁菌门始终占优势；Vasaï等研究发现，12~14周龄的北京鸭和俄国鸭的盲肠拟杆菌的含量与18周龄火鸡盲肠的拟杆菌含量相似。

    王丽凤等研究发现，刚出生的小鸡胃肠道内几乎是无菌的，至出壳第3天在肠道内很多位点才检测出粪链球菌、大肠杆菌类微生物的存在，这与Zhu等的研究结果一致。此外，Xiao等通过16 S rRNA扩增子测序研究了鸡不同肠段（十二指肠、空肠、回肠、盲肠、直肠）部位肠道菌群组成情况，发现不同肠段微生物的组成也有所差异（见表1）。同时Liu等对鹅的不同肠道部位内容物采用鸟枪法宏基因组测序后，发现鹅盲肠内微生物的多样性比较高；而回肠中以乳酸杆菌为主。

1.3.3 影响宿主生长性能

    家禽生长性能研究的核心目标主要集中在增加体重和提高饲料转换效率等。家禽生长性能除了受遗传因素的影响，还直接或间接地受饲料、日龄和环境因素的影响，因此肠道菌群与家禽生产性能之间存在着潜在的相关性。Torok等在研究三种不同饲喂方式对肉鸡饲料报酬时发现，梭菌（Clostridiales）、毛螺菌科（Lachnospiraceaea）、Gallibacterium、肠杆菌（Enterobacteriaceae）等菌群能够与饲料利用率正相关。说明这些菌群在提高宿主饲料转化率方面有潜在的促进作用。Samli等通过向肉鸡饮食中补充益生菌Enterococcus faecium NCIMB 10415，发现试验组与对照组相比肉鸡的体重增加，饲料转化率显著提高，并且回肠的绒毛高度也显著提高。说明添加益生菌Enterococcus faecium NCIMB 10415后，使肉鸡的回肠绒毛高度增加，从而提高了肉鸡胃肠道对营养物质的消化吸收，增强了肉鸡对能量物质的利用，体重增加，饲料转化率显著提高。

    此外，杜云平等在饲料中添加丁酸梭菌，研究发现其不但可以提高肉鸡的日增重和饲料的转化率，而且还可以预防肠炎的发生。此结果与贾志新的研究结论一致。

2.1 遗传因素

   越来越多的证据表明遗传因素对肠道微生物组成具有明显的影响。Xie等 对250对双胞胎个体进行宏基因组测序分析表明遗传和环境因素对肠道微生物组成的影响。研究发现了一些微生物种类以及微生物组的功能原件具有可遗传性。并且鉴定了800万个菌群SNPs以及观察到双胞胎之间的菌群SNPs具有很高的相似性。除此之外，在人类肠道微生物组研究中发现的FUT2和LCT基因 ，小鼠模型中发现的Nod2基因均被报道是影响宿主肠道微生物组成的候选基因 。

2.2 环境因素

2.2.1 垫草

    家禽垫料是指铺在养殖地面的垫料（如：稻草、松针、刨花等），也包括家禽排出来的粪便等混合物，它在家禽整个生长周期中常被重复利用。因此，垫料中的细菌可以通过垫料从一个生长周期传递到下一个生长周期。刚孵出的雏鸡接触到垫草中的细菌后，细菌会伴随饲料等进入未成熟鸡的肠道内。Wang等研究垫料再利用对垫料和鸡肠道菌群的影响时，发现重复利用垫草组鸡回肠黏膜和盲肠内容物的微生物群受到垫料和家禽日龄的双重影响。在10和35日龄，盲肠内微生物的相对丰度显著增加，沙门菌和产气荚膜梭菌的含量减少 ，这样就减少了家禽患病的概率。也有学者指出垫料中微生物的组成和结构也受到所用材料的影响。Cressman等研究表明重复利用化学和微生物条件变化较大的垫料，以及垫料管理方案不善的情况下，会导致垫料湿度、氨以及pH值的增加，而且微生物的密度和多样性也会增加（主要是细菌）。此外，有报道称重回收的草垫可以影响鸡的免疫系统。

2.2.2 养殖方式

    为了保护环境，人们在不断地改进家禽的养殖方式。研究表明，圈养不仅显著影响丹顶鹤肠道中微生物群落组成，还影响了丹顶鹤肠道菌群的结构及多样性，野生丹顶鹤的肠道菌群多样性最低 。这与Waite等在其他动物上的研究相一致，包括濒危的卡卡波鹦鹉、南极海豹和野生捕获的啮齿动物。Degnan等 、Xenoulis等 、Pan等研究发现黑猩猩、野生鹦鹉与人工繁育鹦鹉、家禽的肠道微生物群落组成存在很大差异，因为人工繁育的动物饮食条件比较固定，所以圈养可能对动物的肠道微生物具有很大的影响。

    Best等研究表明，大型饲养场中饲养的北京鸭以变形菌门和厚壁菌门为主，而谷仓里养殖的北京鸭除了变形菌门和厚壁菌门以外，还有饲养场所没有的拟杆菌门。

    同时，地面平养、网上平养、大棚散养、笼养对家禽的生长性能、肠道微生物菌群都有不同程度的影响。

2.3 饮食和饲料添加剂

    饮食组成和饲料添加剂也能影响家禽肠道微生物的多样性以及组成。目前国际上使用最多的添加剂就是益生素，也有将鱼油、植酸酶作为添加剂。

   长期以来，抗生素作为畜禽饲料的一种添加剂，其目的是为了促进畜禽健康和提高生产效率。但是如今抗生素的危害越来越得到畜禽育种工作者的共识。短期的抗生素使用就能使肠道菌群处于一个失衡的状态，还可能促进疾病的发展和恶化。抗生素使用后的一个常见的特征就是肠道菌群功能和分类多样性的缺失。而且一度认为能够防止病原体入侵的上皮细胞肠黏膜厚度也因为抗生素的使用而降低，增加了病原体入侵和疾病风险。

   肉鸡中通过比较食物中添加抗生素（维尼吉亚霉素）和抗生素的替代者（甘露聚糖和木质素），虽然结果显示肉鸡生长性能在两者之间基本相同，但是饲喂甘露聚糖和木质素组别的肉鸡回肠绒毛高度以及绒毛杯状细胞数目显著高于抗生素使用组，并且提高了结肠中有益菌的数目 。

   Fonseca等研究发现，饲料中添加益生菌对家禽性能有一定的影响，能够降低1、7、18日龄家禽肠道内容物的pH值，增加家禽回肠绒毛的高度。在家禽中，低pH值的环境可以显著降低致病菌的定植。此外，高浓度的乳酸杆菌也能够抑制致病菌。饲喂益生菌24 h后，家禽肠道内容物的pH值显著降低。研究表明，一定浓度的枯草芽孢杆菌不仅能够增强家禽和仔猪的生长性能，还能够提升免疫力，更能够促进产蛋后期蛋鸡的生产性能，减少肠道梭菌和空肠弯曲杆菌，提高乳酸杆菌和双歧杆菌丰度。

    最新研究发现，在超过170代的试验进化后，适应了营养不良饮食的果蝇幼虫，在消化蛋白及多糖时对菌群的依赖性显著降低。就此看来，饮食和添加剂对家禽肠道微生物的影响还是很显著的。

2.4 日龄

    研究表明家禽的肠道微生物是在出生后的早期发育过程形成的（尤其是在刚出生的两周），这与哺乳动物肠道微生物方面的研究报道相似。

   Hiett等和Cox等已经证明刚孵化出来的小鸡从孵化间转移到雏舍的1~2 d内，其肠道内最初的肠道微生物数量和种类都很少。

    Lu等 的研究表明，肉鸡盲肠微生物组成分别在第3、7、14~28及49日龄之间存在显著差异，而且肠道微生物的群落组成也会随着日龄的增加呈现阶段性的变化。

   此外，Best等通过对为期6周时间内北京鸭盲肠部位菌群动态变化的监测发现，北京鸭的盲肠菌群组成始终处在动态变化过程中，在孵化后第4~10天期间变化最大。说明不同物种的家禽其肠道微生物菌群组成均受到日龄大小的影响，而且在发育阶段处于一个动态变化的过程，但是，总的来说，随着日龄的增加，家禽肠道微生物组成的多样性也随着增加，直到肠道发育完全后，肠内的微生物群落也会趋于一个稳定的状态。

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【主要作用】

1、节约饲料成本：本品在动物体内大量繁殖代谢，产生大量的淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶等，能促进动物对糖类、蛋白质和脂肪的消化吸收，乳酸菌的分泌的乳酸等酸性物质使肠道环境呈酸性，也有利于营养素的消化吸收，因此本品能提高鸡群对饲料的消化吸收率，降低料耗，节约成本。

2、改善养殖生态环境：有效调节鸡的肠道菌群平衡，明显改善肠道微生态环境，抑制沙门氏菌、致病性大肠杆菌的生长和繁殖，从而降低粪便与养殖环境的氨氮味、臭味、异味，改善饲养环境。垫料中的致病菌量会明显下降，能够减少养殖环境及粪便中有机磷等有害物质的含量，减少污染。连续使用本品后，养殖场遍布有益菌，形成益生菌生态养殖环境，粪污水道与储水池能够自动分解改善水质，通过沼气或多级储水池过滤后结合如水生植物等措施能够达到合格排放；

3、减少鸡粪含水量，并消除鸡粪产生的氨氮。清理出来的鸡粪便能够自动快速发酵（含水量低于70%，注意薄膜覆盖密封）成生物菌肥，保护了生态环境。

4、保健效果明显：本品中的以乳酸菌为主的益生菌，鸡食用后能顺利通过胃酸及胆汁的考验，抵达肠道后能迅速增值，促进鸡肠道有益菌落如双歧杆菌、乳酸杆菌的生长，拮抗和抑制肠道内有害菌增殖，纠正肠道菌群紊乱，使鸡肠道菌群正常化，对鸡群肠道保健效果显著。使用本产品后能够明显提高雏鸡的成活率、减少肠道健康问题的发生，鸡群健壮整齐，毛色光顺漂亮。

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8、本品所用菌株稳定性好，抗逆性强，具有耐热、耐酸、耐胆汁、无污染、无任何违禁物质、绿色环保的特点，可长期添加。